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Plataforma de Proteómica
Durante el 2016 la plataforma de proteómica ha dado servicio y colaborado con diferentes grupos del CIBEREHD (Hospital Princesa, H. Clinic, ITGP, BioDonostia y CIC bioGUNE). Se han publicado 4 artículos en revistas científicas de impacto internacional. En colaboración con el Dr. J Bañales (BioDonostia),
se han obtenido resultados en preparaciones de exosomas extraídos de sangre de pacientes con colangiocarcinoma. En la línea de implementar la denominada “biopsia líquida” junto con la Dra. María Chaparro y el Dr. Javier Gisbert (H. Princesa) se han identificado marcadores en exosomas extraidos
de sangre en la enfermedad de Crohn e inflamación intestinal. Asímismo, mediante la detección e identificación de péptidos endógenos en orina mediante nLC MS/MS) se han analizado pacientes cirróticos con función renal comprometida (Dr. Ginés, H. Cliníc). Finalmente, en un trabajo dirigido por la Dra. Martinez-Chantar se han realizado un análisis de los supercomplejos de la cadena respiratoria mitocondrial formados tras el tratamiento con acetaminophen mediante nLC MS/MS.
Plataforma de Metabolómica
La plataforma ha realizado 20 servicios a grupos de investigación y empresas farmacéuticas interesados en cuantificar en hígado los niveles de metabolitos del ciclo de la metionina y derivados (Alonso C et
al Gastroenterology). Además se han ampliado las matrices biológicas para determinar este panel de metabolitos en tejido adiposo. Se ha desarrollado la metodología para llevar a cabo estudios de fluxomica en células y en hígados. Se ha incorporando las medidas del metabolismo del colesterol a las capacidades de la plataforma, así como metabolitos asociados a toxicidad hepática NAPQI-GSH. Por otro lado se
han desarrollado y aplicado métodos para determinar de manera específica y sensible las actividades enzimáticas MAT y COMT en muestras de hígado y suero, y parte de los resultados obtenidos forman parte de la publicación Frontiers in Pharmacology, 2016.
Plataforma de Metabolómica (RMN)
El análisis metabolómico por RMN de muestras de suero ha permitido establecer un protocolo de separación entre los estadios 1 y 4 de la fibrosis hepática (PLoS ONE) y (Current Topics in Medicinal Chemistry).
Se detalla el estado actual de los diferentes proyectos de la plataforma:
• Determinación de la “salud metabólica” en adultos. Monitorización de perfiles normales y patológicos de una porción significativa de la población de la CAV (como región de estudio). Se analizarán 20000 muestras durante el período 2016-2017.
• Determinación de biomarcadores de sindrome metabólico. Para ello analizarán muestras de orina de pacientes con sindrome metabólico y con riesgo cardiovascular. Se efectuará un análisis estadístico multi- y univariante de los perfiles. En este sentido se cuentan con un conjunto de 3000 muestras bien anotadas, provenientes de la Universitat de València.
• Identificación de patologias congénitas en neonatos. En colaboración con los cuatro hospitales con unidades de neonatología de la CAPV se ha investigado el uso de RMN para el análisis de orina de neonatos (500 muestras) con el fin de detectar evidencias metabólicas derivadas de una serie de enfermedades congénitas.
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