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Plataforma de Proteómica
El 2015 la plataforma de proteómica ha dado servicio y colaborado con diferentes grupos del CIBEREHD (bioGUNE, H. Clinic, ITGP y BioDonostia). Se han publicado 6 artículos en revistas científicas de impacto internacional. Además, se han puesto a punto métodos de preparación de muestra y adquisición para la denominada peptidómica. Por último, el trabajo realizado en la puesta a punto de la cuantificación diferencial de proteomas por el método de cromatografía líquida a escala nano
Platafornas
Plataforma de Metabolómica (RMN)
Durante 2015, la plataforma de metabolómica por RMN ha consolidado y validado los procedimientos estandarizados de trabajo para el análisis metabo- lómico de muestras de orina y de suero. Específi- camente se han adecuado los protocolos de prepa- ración de muestra y adquisición de espectros a los establecidos por la empresa Bruker y el consorcio internacional liderado por el Imperial College y se han implementado las soluciones informáticas ne- cesarias para el análisis univariante y multivariante
acoplada en línea a espectrómetros de masas en tándem mediante la aproximación libre de marcaje (Label-Free nLC MS/MS Quantification), se ha visto reflejada en la publicación de la colaboración realizada con el Dr. Woddhoo (Gómez-Sánchez et al. J Cell Biol).
de los conjuntos de datos.
En el terreno de aplicaciones, se han analizado un conjunto de muestras de suero provenientes de pa- cientes con fibrosis hepática. El análisis metaboló- mico por RMN ha permitido establecer un protocolo de separación entre los estadios 1 y 4 de la fibrosis hepática y ha identificado metabolitos que son sus- ceptibles de ser marcadores de progresión fibrótica. Dichos resultados están recogidos en una publica- ción científica (actualmente en revisión).
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